
Mobil Element Araştırma Grubu
Grup Hakkında
Grubun çalışma alanı ve hedefleri.
Mobil Element Araştırma Grubu, hareketli genetik elementlerin genom çeşitliliği, gen ifadesi ve çevresel stres yanıtlarıyla ilişkisini araştırır. Çalışmalarımız retrotranspozonlar ve endojen retrovirüsler üzerine yoğunlaşır; bitki ve insan örneklerinde bu elementlerin dağılımını ve bireyler arasındaki farklılıklarını moleküler yöntemlerle inceleriz.
Pirinç, arpa ve mısır gibi bitkilerde retrotranspozon temelli belirteçlerden yararlanarak genetik çeşitliliği, doku kültürüne bağlı değişimleri ve stres koşullarındaki yanıtları değerlendiririz. İnsan örneklerindeki endojen retrovirüs polimorfizmleri ve DNA hasarı ile onarımına ilişkin çalışmalarımızla genom dinamiklerini farklı biyolojik sistemlerde ele alırız.
Ekip
Grubun akademik kadrosu ve lisansüstü öğrencileri.

Araştırmacılar
Doktora ve Yüksek Lisans Öğrencileri

Elif Zeynep Benli
Misafir Araştırmacılar
Araştırma Konuları
Grubun odaklandığı bilimsel sorular.
Mobil Genetik Elementler
Retrotranspozonlar
Endojen Retrovirüsler
Projeler
Yürütülen ve tamamlanan araştırma projeleri.
Comet Assay Testinin S. pombe Mayasında DNA Hasarını Göstermek İçin Optimize Edilmesi
Covid-19 Geçirmiş Kronik Böbrek Hastalığı Olan Çocuklarda DNA Hasarı ve DNA Onarımının Belirlenmesi
Kuraklık Stresi Altındaki Farklı Kosova Yerel Mısır Genotiplerindeki Fizyolojik ve Biyokimyasal Yanıtlar ile Retrotranspozon Değişimlerin Belirlenmesi
Schizosaccharomyces pombe Mayasında qPCR Temelli Gen Ekspresyon Analizleri İçin Kullanılabilecek Referans Gen Primerlerinin Geliştirilmesi
Meme Kanseri Tanısında Kullanılabilecek Retrotranspozon Temelli Markır Yönteminin Geliştirilmesi
Saccharomyces cerevisiae Mayasında Retrotranspozon Temelli Marker Yönteminin Geliştirilmesi
Fare Embriyonik Fibroblast Hücrelerinde Kültür Süresine Bağlı DNA Metilasyonu Değişimlerinin Belirlenmesi
Çeltik (Oryza sativa) Bitkisinde CBDP Temelli Polimorfizm Uygulamasının Geliştirilmesi
Nazal Polipozis Tanısı İçin Marker Olarak Kullanılabilecek İnsan Endojen Retrovirüslerinin Belirlenmesi
Fusarium Türlerinde Genom Boyunca ve Gene Özgün Epigenetik Analizler
Herbisidlerin Pirinç (Oryza sativa L.) Bitkisinde Transpozon Hareketleri Üzerine Etkileri
Schizosaccharomyces pombe Mayasında Abiyotik Stresin Retrotranspozon Hareketliliğine Olan Etkisinin Belirlenmesi
Pirinç (Oryza sativa L.) Bitkisinde Transpozon Analizleri
Arpa (Hordeum vulgare L.) Doku Kültüründe Retrotranspozon Hareketlerinin ve Ürünlerinin Belirlenmesi
Yayınlar
Grubun hakemli dergilerde yayımlanan çalışmaları.
-
2026
Jakupi M., Demirbaş S., Yilmaz S., Aliu S.
Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi 23(3): 1078-1090
-
2024
Ibisoglu M. S., Tan M., Yilmazer M., Yilmaz S., Uzuner S. K., Topal-Sarikaya A., Palabiyik B.
Archives of Microbiology 206(4): 155
-
2022
UZ G., PESEN T., BERBER A., KIĞ C., PALABIYIK B., TOPAL SARIKAYA A.
International Journal of Life Sciences and Biotechnology 5(3): 335-345
-
2022
ARICAN E., DEMİRBAŞ S.
Journal of Agricultural Sciences (Tarım Bilimleri Dergisi) 28(4): 592–602
-
2022
Arı T., Demirbaş S., Bilgen B. B.
International Journal of Innovative Approaches in Agricultural Research 6(4): 303-317
-
2020
Investigation of rice (Oryza sativa L.) retrotransposons in different taxa
Tufan A. F., Ibisoglu M. S., Yilmaz S., Gozukirmizi N.
Genetic Resources and Crop Evolution 67(6): 1473-1479
-
2019
The effects of insulin and glucose on growth and expression of mar regulon in E. coli
GÜMÜŞ D., KALAYCI YÜKSEK F., UZ G., BAYRAKTAR A., KÖSEOĞLU P., OFLUOĞLU Y., DAYLAN B., ANĞ KÜÇÜKER M.
Turkish Journal of Clinics and Laboratory 10(2): 209-216
-
2019
IRAP-PCR As A Tool For Screening HERV Polymorphisms In Nasal Mucosal Swabs
Kepekçi A. H., İbişoğlu M. S., Yılmaz S., Kığ C.
ENT Updates
-
2018
Genotyping via Sequence Related Amplified Polymorphism Markers in Fusarium culmorum
Zümrüt I. M., Tunalı B., Kansu B., Uz G., Yörük E., Ölmez F., Sarıkaya A.
Turkish Journal of Agriculture - Food Science and Technology 6(2): 145
-
2018
Effects of Insulin, Norepinephrine and Estradiol on Growth of Different Microorganisms
Gümüş D., Kalaycı Yüksek F., Uz G., Bilgin M., Anğ Küçüker M.
Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi
-
2018
Short-term mutagenicity test by using IRAP molecular marker in rice grown under herbicide treatment
Yilmaz S., Marakli S., Yuzbasioglu G., Gozukirmizi N.
Biotechnology & Biotechnological Equipment 32(4): 923-928
-
2017
DNA fingerprinting in rice (Oryza sativa L.) with transposon markers
Gozukirmizi N., Yuzbasioglu G., Yilmaz S.
Acta Horticulturae (1187): 251-260
-
2016
The effect of magnesium on mitotic spindle formation in Schizosaccharomyces pombe
Uz G., Sarikaya A. T.
Genetics and Molecular Biology 39(3): 459-464
-
2016
Transposon Activity in Plant Genomes
Gozukirmizi N., Temel A., Marakli S., Yilmaz S.
Plant Omics: Trends and Applications Springer International Publishing, pp. 83-108
-
2016
Analysis of Hopi/Osr27 and Houba/Tos5/Osr13 Retrotransposons in Rice
Yuzbasioglu G., Yilmaz S., Marakli S., Gozukirmizi N.
Biotechnology & Biotechnological Equipment 30(2): 213-218
-
2016
Houba retrotransposon-based molecular markers: a tool for variation analysis in rice
YÜZBAŞIOĞLU G., YILMAZ S., GÖZÜKIRMIZI N.
TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY 40: 456-464
-
2015
Yilmaz S., Gozukirmizi N., Scott R. J., Taskin K. M.
Plant Cell Biotechnology and Molecular Biology 16(1–2): 74–83
-
2014
BAGY2 Retrotransposon Analyses in Barley Calli Cultures and Regenerated Plantlets
Yilmaz S., Marakli S., Gozukirmizi N.
Biochemical Genetics 52(5-6): 233-244
-
2014
Effects of epirubicin on barley seedlings
Hamat-Mecbur H., Yilmaz S., Temel A., Sahin K., Gozukirmizi N.
Toxicology and Industrial Health 30(1): 52-59
-
2014
Changes in human sirtuin 6 gene promoter methylation during aging
SAHIN K., YILMAZ S., GOZUKIRMIZI N.
Biomedical Reports 2(4): 574-578
-
2014
Sukkula retrotransposon insertion polymorphisms in barley
Kartal-Alacam G., Yilmaz S., Marakli S., Gozukirmizi N.
Russian Journal of Plant Physiology 61(6): 828-833
-
2013
Transformation of Nicotiana tabacum with dehE gene
Kaya Y., Yilmaz S., Marakli S., Gozukirmizi N., Huyop F.
Journal of Food, Agriculture & Environment 11(3–4): 777–780
-
2013
Evaluation of Transgenic Nicotiana tabacum with dehE Gene Using Transposon Based IRAP Markers
Kaya Y., Yilmaz S., Gozukirmizi N., Huyop F.
American Journal of Plant Sciences 04(08): 41-44
-
2013
Human endogenous retrovirus-H insertion screening
GULIYEV M., YILMAZ S., SAHIN K., MARAKLI S., GOZUKIRMIZI N.
Molecular Medicine Reports 7(4): 1305-1309
-
2013
Variation of Retrotransposon Movement in Callus Culture and Regenerated Shoots of Barley
Yilmaz S., Gozukirmizi N.
Biotechnology & Biotechnological Equipment 27(6): 4227-4230
-
2012
Nikita retrotransposon movements in callus cultures of barley (Hordeum vulgare L.)
Bayram E., Yilmaz S., Hamat-Mecbur H., Kartal-Alacam G., Gozukirmizi N.
Plant Omics 5(3): 211–215
-
2012
BARE1 and BAGY2 Retrotransposon Movements and Expression Analyses in Developing Barley Seedlings
Marakli S., Yilmaz S., Gozukirmizi N.
Biotechnology & Biotechnological Equipment 26(6): 3451-3456
-
2011
DNA methylation variations between mono- and dizygotic twins
Sahin K., Yilmaz S., Temel A., Gozukirmizi N.
Romanian Biotechnological Letters 16(4): 6460–6466
-
2011
Variations in BARE-1 insertion patterns in barley callus cultures
Evrensel C., Yilmaz S., Temel A., Gozukirmizi N.
Genetics and Molecular Research 10(2): 980-987
Kongreler
Ulusal ve uluslararası kongre katılımları.
-
2025
Yılmaz S., Özdemir K., Salaş C. B., Beyaz S. Y., İbişoğlu M. S., Kankaya S., et al.
International 8th Bursa Scientific Research Congress Türkiye, 16 Aralık 2025
-
2025
Antioxidant Responses of Kosovo Maize Genotypes to PEG-Induced Drought Stress
Jakupi M., Demirbaş S., Yılmaz S.
7th Eurasia Biochemical Approaches & Technologies Congress (EBAT 2025)
-
2025
Jakupi M., Yılmaz S., Demirbaş S.
7th Eurasia Biochemical Approaches & Technologies Congress (EBAT 2025)
-
2024
Optimization of CBDP marker to determine allelic variation in rice cultivars (Oryza sativa L.)
İbişoğlu M.S., Sefer Ö., Yörük E., Yılmaz S.
XV International Scientific Agriculture Symposium (Agrosym 2024) Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
-
2023
İbişoğlu M. S., Palabıyık B., Yılmaz S., Topal Sarıkaya A.
31st International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (ICYGMB 2023)
-
2020
Genome-wide and gene-specific epigenetic analyses in Fusarium species
Sefer Ö., İbişoğlu M.S., Yörük E., Yılmaz S.
IV. International Eurasian Agriculture and Natural Sciences Congress
-
2019
Retrotransposon Mediated Biodiversity
İbişoğlu M. S., Tufan A. F., Yılmaz S.
2nd International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2019)
-
2019
HERV Polymorphisms: A Potential Diagnostic Marker for Nasal Polyposis
Kepekçi A. H., İbişoğlu M. S., Yılmaz S., Kığ C.
2nd International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2019)


