
Hesaplamalı Biyoloji Araştırma Grubu
Grup Hakkında
Grubun çalışma alanı ve hedefleri.
Hesaplamalı Biyoloji Araştırma Grubu, biyolojik sistemleri genomik, transkriptomik ve multiomik veriler üzerinden inceler. Gen anlatımı, genetik varyasyonlar ve moleküler etkileşimlere ilişkin verileri biyoinformatik yöntemlerle değerlendirerek hücresel süreçlerin ve hastalıklarla ilişkili mekanizmaların anlaşılmasına katkıda bulunmayı amaçlar.
Çalışmalarımız; dizileme verilerinin analizi, işlevsel ve yolak analizleri, biyolojik ağların incelenmesi ve farklı omik veri katmanlarının bütünleştirilmesini kapsar. Moleküler docking ve yapı temelli hesaplamalı yaklaşımlarla bileşik–protein etkileşimlerini araştırıyor, deneysel çalışmalarda sınanabilecek adaylar ve hipotezler geliştiriyoruz.
Ekip
Grubun akademik kadrosu ve lisansüstü öğrencileri.

Araştırmacılar
Doktora ve Yüksek Lisans Öğrencileri

Abdulkadir Görkem Çoşkun

Elif Zeynep Benli
Misafir Araştırmacılar
Araştırma Konuları
Grubun odaklandığı bilimsel sorular.
Genomik ve Genetik Varyant Analizi
Transkriptomik ve İşlevsel Analizler
Multiomik Veri Bütünleştirme
Moleküler Docking ve Yapı Temelli Analizler
Biyolojik Ağlar ve Sistem Biyolojisi
Projeler
Yürütülen ve tamamlanan araştırma projeleri.
GPR146 Genindeki Polimorfizmlerin Prostat Kanseri Yatkınlığı ile İlişkisinin Değerlendirilmesi
Erken Yaşta Görülen Akut Miyokard Enfarktüsü ile İlişkili SNP’lerin Biyoinformatik Yöntemlerle Belirlenmesi ve Türk Popülasyonunda Risk Analizi
Isthmin ISM1 Geninde Kodlanan Tek Nükleotid Polimorfizmlerinin in silico Analizi ve Mesane Kanseri ile İlişkisinin Araştırılması
Yayınlar
Grubun hakemli dergilerde yayımlanan çalışmaları.
-
2026
Turgut Genç T., Kaya S., Günay M.
Bulletin of Entomological Research 116(3): 303–315
-
2026
Cicekliyurt M. M., Kilic S. O., Mermutlu S. I., Gunay M.
Anais da Academia Brasileira de Ciências 98(1): e20250326
-
2026
Günay M., Hız M. M.
Journal of Advanced Research in Natural and Applied Sciences 12(1): 1–14
-
2026
Günay M., Hız-Çelikliyurt M. M., Akkuş G., Korkmaz Ş. A.
International Journal of Molecular Sciences 27(2): 931
-
2026
Transcriptional Reprogramming of Lifespan-Associated Genes in Yeast Lacking TOR1
Turgut Genç T., Günay M.
Biochemical Genetics 64(4): 5996–6026
-
2026
Günay M., Benli E. Z., Işık M., Çoşkun A. G.
IYYU Journal of PhytoPharmacy 2(3): 81–94
-
2025
Investigating the cytotoxicity and genotoxicity of Vortioxetine with in vivo and in silico methods
Çicekliyurt M. M., İnan P., Günay M., Akkuş G., Çiçekliyurt A.
Scientific Reports 15(1): 33647
Kongreler
Ulusal ve uluslararası kongre katılımları.
-
2026
Birgün T., Topaloğlu A., Esen Ö., Baysan M., Çakar Z. P.
The International Graduate Research Symposium (IGRS)
-
2025
Biyokontrol Ajanlarının Etkisi Altındaki Fusarium spp.’de Transkriptomik İncelemeler
Orhan B., Birgün T., Yörük E.
8th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2025)
-
2024
Cell-Specific Prediction of Protein-Protein Interaction Networks in Huntington’s Disease
Sönmez E., Birgün T., Çimen H.
6th TuPA International Proteomics Congress Kocaeli, Türkiye
