
Bitki Patolojisi Araştırma Grubu
Grup Hakkında
Grubun çalışma alanı ve hedefleri.
Bitki Patolojisi Araştırma Grubu, arpa ve buğday hastalıklarının moleküler temellerini ve bitki–patojen etkileşimlerini araştırır. Çalışmalarımız, tahıl patojenlerinin biyolojisinin anlaşılmasına ve hastalıklarla mücadele için deneysel yaklaşımlar geliştirilmesine odaklanır.
Moleküler biyoloji ve genetik yöntemlerini mikrobiyolojik deneylerle birleştirerek patojenlerin ve konak bitkilerin farklı koşullara verdikleri yanıtları inceliyoruz. Bu çalışmalarla bitki sağlığına ilişkin temel bilgiyi genişletmeyi ve sonraki araştırmalara dayanak oluşturmayı amaçlıyoruz.
Ekip
Grubun akademik kadrosu ve lisansüstü öğrencileri.

Araştırmacılar

Özlem Sefer
Esma Özsoy
Doktora ve Yüksek Lisans Öğrencileri
Elif Orhan Duman
Melis Sınav
Semih Erlik
Araştırma Konuları
Grubun odaklandığı bilimsel sorular.
Tahıl Patojenlerine Karşı Antifungal Tarama
Mikotoksin Biyosentezi ve Genetik Düzenleme
Mikroorganizmalarda Hücresel ve Epigenetik Yanıtlar
Gen Susturma ve Gen Anlatımı İçin Vektör Geliştirme
Bitki Patojenlerinde Popülasyon Genetiği
Yerli Tahıl Çeşitlerinde Biyotik ve Abiyotik Stres
Projeler
Yürütülen ve tamamlanan araştırma projeleri.
Fusarium graminearum’da Pestisit Etki Mekanizmasının siRNA Susturması ile Belirlenmesi
Etkisi Bilinmeyen Bir Fungusit Olan Dodine’nin Fusarium graminearum Transkriptomundaki Etkisinin RNA-seq ile Belirlenmesi ve Gen Anotasyonu ile Metabolik Yolaklarının Aydınlatılması
Hasat Sonrası Üzüm Salkım Çürüklüğünün Trichoderma ile Biyolojik Mücadelesi
Triticum aestivum-Fusarium graminearum Fitopatolojisinde Nanopartikül Aracılı Foliar RNAi Uygulamalarının Etkilerinin İncelenmesi
Bitkisel Alkaloid, Fenolik ve Terpen Bileşiklerinin Fusarium graminearum Etkenine Etkilerinin RNA-seq Temelli Karakterizasyonu
Fusarium Türlerinde Genom Boyunca ve Gene Özgün Epigenetik Analizler
Yayınlar
Grubun hakemli dergilerde yayımlanan çalışmaları.
-
2026
Sefer Ö., Maraklı S.
Journal of Plant Pathology 108(1): 411–420
-
2026
Potential Antifungal Effects of Plant-Derived Essential Oils in Disease Management
Yörük E., Sefer Ö.
Life Sciences and Biotechnology in Agriculture and Medicine Cambridge University Press, pp. 1-25
-
2026
-
2026
Şekerli M., Tufan Dülger A. F., Uçarlı C., Yörük E.
Plant Molecular Biology Reporter 44(3): 110
-
2026
Doğan Ö., Bakmaz D., Dülger A. F. T., Yörük E., Yıldırım M., Korkmaz E. M., Budak M.
European Journal of Plant Pathology
-
2025
Özsoy E., Barak T. H., Yörük E., Servi H., Yli-Mattila T.
Pathogens 14(4): 383
-
2025
Yücesan F. B., Sefer Ö., Yörük E.
Cumhuriyet Science Journal 46(2): 257–263
-
2025
Ferhat I., Harrat W., Yörük E., Harfi B.
Plant Gene 44: 100546
-
2025
Yörük E., Ünal S., Özsoy E., Sefer Ö., Dülger A. F. T., Öztürk Z. N.
Cereal Research Communications 53(3): 1235–1247
-
2024
Physiological, genetic and transcriptional characterization of Fusarium graminearum isolates
Teker T., Khalid S.A., Yörük E., Albayrak G.
Sigma Journal of Engineering and Natural Sciences 42(2): 450–458
-
2024
Yörük E., Yli-Mattila T.
Diversity 16(8): 481
-
2024
Cumin Seed Oil Induces Oxidative Stress-Based Antifungal Activities on Fusarium graminearum
Yörük E., Danışman Z., Pekmez M., Yli-Mattila T.
Pathogens 13(5): 395
-
2023
Simplified mini-prep method for Taq DNA polymerase extraction
Yörük E.
Transactions of the Institute of Molecular Biology & Biotechnologies 7(1): 132–135
-
2023
Sadigova A., Yörük E., Mammadova M., Garagözov T.
Transactions of the Institute of Molecular Biology & Biotechnologies 7(1): 76-81
-
2023
-
2023
Gazdağlı A., Baştemur G. Y., Yörük E., Özkorucuklu S. P., Albayrak G.
Brazilian Archives of Biology and Technology 66: e23210821
-
2023
Özkale E., Yörük E., Budak M., Korkmaz E. M.
Plant Pathology 72(8): 1428–1441
-
2023
Yörük E.
Zemdirbyste-Agriculture 110(4): 375–382
-
2023
Investigation of the Antifungal Activity of Bacillus megaterium Against Fusarium Species
Keleş Keyfoğlu E. N., Tufan Dülger A. F., Yörük E.
Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 33(2): 183–191
-
2023
Investigation of antifungal activities of myrcene on Fusarium reference strains
Albayrak G., Yörük E., Teker T., Sefer Ö.
Archives of Microbiology 205(3): 82
-
2023
Sefer Ö., Özsoy E., Yörük E., Özkale E.
Frontiers in Fungal Biology 4: 1278525
-
2022
The Epigenetic Approaches in Filamentous Fungi
Özsoy E., Sefer Ö., Yörük E.
Biotechnological Advances for Epigenetics pp. 2-60
-
2022
Danışman Z., İnan Ş., Özsoy E., Yörük E., Yli-Mattila T.
Trakya University Journal of Natural Sciences 23(1): 71–79
-
2022
Taghiyeva A., Tufan Dülger A.F., Yörük E., Aslan Engin T.
Anatolian Journal of Botany 6(2): 104-108
-
2022
Abstracts of presentations at the XXVII Congress of the Italian Phytopathological Society (SIPaV)
Yörük E., Oufensou S., Sefer Ö., Migheli Q., Balmas V.
Journal of Plant Pathology 104(4): 1280
-
2022
Yörük E., Özkale E., Sefer Ö., Özsoy E.
Journal of Plant Pathology 104(3): 1039–1047
-
2022
Risk Assessment of Tetraconazole Fungicide at the Molecular Level in Hordeum vulgare L.
Tufan Dülger A. F., Yörük E.
Biology Bulletin 49(4): 292–298
-
2022
Yüksektepe B., Sefer Ö., Varol G., Teker T., Arslan M., Çetin B., Mert F., Yörük E., Albayrak G.
European Journal of Biology 81(1): 107–116
- 2021
-
2021
Kalayci Yuksek F., Gumus D., Uz G., Sefer O., Yoruk E., Ang Kucuker M.
Clinical and Experimental Health Sciences 11(2): 209–214
-
2021
Do norepinephrine and estradiol affect the growth of Escherichia coli and expressions of Mar genes?
Gümüş D., Kalaycı Yüksek F., Sefer Ö., Yörük E., Uz G., Küçüker A. M.
Experimed 11(3): 200–206
-
2021
Yörük E., Keleş E., Erlik S., Yıldız S., Kocabaş G., Özsoy E.
Journal of the Institute of Science and Technology 11(4): 2498-2505
-
2021
Teker T., Sefer Ö., Gazdağlı A., Yörük E., Varol G. İ., Albayrak G.
European Journal of Plant Pathology 160(3): 611–622
-
2020
TUFAN F.
ANADOLU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES 1-7
-
2020
Tufan F., Keleş E.N., Sefer Ö., Eraslan M., Sefalı S., Güngör Ö., Yörük E.
Anadolu Journal of Agricultural Sciences 35(1): 1–7
-
2019
Class B-Trichothecene Profiles of Fusarium Species as Causal Agents of Head Blight
Yörük E., Yli-Mattila T.
Advancing Frontiers in Mycology & Mycotechnology Springer Singapore, pp. 347-376
-
2019
Yörük E., Albayrak G.
Journal of Environmental Biology 40(3): 370–376
-
2019
First Report on Identification of Fusarium graminearum Species Complex Members from Turkey and Iran
Tunalı B., Yörük E., Sefer Ö., Kansu B., Sharifnabi B.
Turkish Journal of Agriculture - Food Science and Technology 7(7): 1040–1045
-
2019
The roles of hormones in the modulation of growth and virulence genes’ expressions in UPEC strains
Gümüş D., Kalaycı Yüksek F., Sefer Ö., Yörük E., Uz G., Anğ Küçüker M.
Microbial Pathogenesis 132: 319–324
-
2019
Albayrak S., Albayrak G., Çelikkol M. T., Gazdağlı A., Yörük E., Çağlar S.
Marine Pollution Bulletin 149: 110662
-
2018
Tetraconazole leads to alterations in Fusarium graminearum at different molecular levels
Yörük E.
Applied Ecology and Environmental Research 16(5): 6155–6167
-
2018
Investigation of the Effects of Eugenol on Fusarium culmorum
Yörük E., Sefer Ö., Sezer A.S., Konukçu Z., Develi E.S.
Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 8(2): 215–221
-
2018
Alterations of growth rate and gene expression levels of UPEC by antibiotics at sub-MIC
Gümüş D., Kalaycı-Yüksek F., Yörük E., Uz G., Çelik E., Arslan C., Aydın E.M., Canlı C., Anğ-Küçüker M.
Folia Microbiologica 63(4): 451–457
-
2018
FcMgv1, FcStuA and FcVeA Based Genetic Characterization in Fusarium culmorum (W.G. Smith)
Yörük E., Sefer Ö.
Trakya University Journal of Natural Sciences 19(1): 63–69
-
2018
Salinity and drought stress on barley and wheat cultivars planted in Turkey
Yörük E., Keleş E., Sefer Ö., Eraslan M.
Journal of Environmental Biology 39(6): 943–950
-
2018
Yörük E., Sefer Ö., Tunalı B., Kansu B., Sharifnabi B., Yli-Mattila T.
Journal of Plant Pathology 100(3): 447–455
-
2018
Gazdağlı A., Sefer Ö., Yörük E., Varol G. İ., Teker T., Albayrak G.
Pathogens 7(4): 90
-
2017
Multiplex Detection of Fusarium Species
Yli-Mattila T., Nayaka S. C., Venkataramana M., Yörük E.
Methods in Molecular Biology Springer New York, pp. 269-291
-
2017
Üreme Koşullarının Fusarium culmorum’da tri4 Gen Anlatımı Üzerine Etkisi
Emre Yörük, Aylin Gazdağlı, Gülruh Albayrak
Journal of Agricultural Faculty of Gaziosmanpasa University 34(2017-2): 91-97
-
2017
SEFER Ö., YÖRÜK E., DEVELİ E. S., SEZER A. S., KONUKCU Z.
International Journal of Secondary Metabolite 113-113
-
2017
Gumus D., Yoruk E., Kalayci-Yuksek F., Uz G., Topal-Sarikaya A., Ang-Kucuker M.
Clinical Laboratory 63(10/2017)
-
2016
Genetic diversity among Fusarium graminearum and F. culmorum isolates based on ISSR markers
Albayrak G., Yörük E., Gazdağli A., Sharifnabi B.
Archives of Biological Sciences 68(2): 333-343
-
2016
Gürel F., Öztürk N. Z., Yörük E., Uçarlı C., Poyraz N.
Plant Growth Regulation 80(2): 183-193
-
2016
Yörük E., Tunali B., Kansu B., Ölmez F., Uz G., Zümrüt I. M., Sarıkaya A., Meyva G.
Journal of Plant Diseases and Protection 123(4): 177-186
-
2015
AKAYLI T., ALBAYRAK G., ÜRKÜ Ç., ÇANAK Ö., YÖRÜK E.
Mediterranean Marine Science 17(1): 163
-
2015
Yörük E., Karlik E., Gazdagli A., Kayis M., Kaya F., Albayrak G.
Iranian Journal of Biotechnology 13(2): 53-57
-
2015
Yörük E., Albayrak G.
Biotechnology & Biotechnological Equipment 29(2): 268-273
-
2014
Characterization of GnRH, ILGFRI and AR Genes in Sturgeon’s Genomics
Şengör G. F. Ü., Albayrak G., Yörük E.
Israeli Journal of Aquaculture - Bamidgeh 66
-
2014
Class B trichothecene chemotyping in Fusarium species by PCR assay
Yörük E., Gazdağli A., Albayrak G.
Genetika 46(3): 661-669
-
2014
Tri4 and tri5 Gene Expression Analysis in Fusarium graminearum and F. culmorum Isolates by qPCR
Yoruk E., Albayrak G.
Plant Pathology Journal 13(2): 133-138
-
2013
Yörük E., Albayrak G.
Genetics and Molecular Research 12(2): 1360-1372
-
2012
Albayrak G., Yoruk E., Diken O.
New Biotechnology 29: S22
-
2012
Genotyping of Fusarium graminearum and F. culmorum isolates by microsatellite markers
Yörük E., Gazdagli A., Albayrak G.
Journal of Biotechnology 161: 16
-
2012
Chemotyping of Fusarium graminearum and F. culmorum Isolates from Turkey by PCR Assay
Yörük E., Albayrak G.
Mycopathologia 173(1): 53-61
-
2011
Yoruk E., Tufan F., Ucarli C., Gurel F.
Current Opinion in Biotechnology 22: S136
-
2011
Yoruk E., Albayrak G., Sharifnabi B., Candar B.
Current Opinion in Biotechnology 22: S132
Kongreler
Ulusal ve uluslararası kongre katılımları.
-
2026
Nanocarrier-Assisted Foliar Applications in RNAi-Based Plant Protection Systems
Çintesun Ş., Sefer Ö., Yörük E., Maraklı S.
8th International Anatolian Agriculture, Food, Environment and Biology Congress Sinop, Türkiye
-
2026
Fusarium graminearum’a karşı çeşitli antifungallerin in vitro etkinlik değerlendirmesi
Sefer Ö., Maraklı S.
TROIA 4th International Conference on Applied Sciences Çanakkale, Türkiye
-
2025
Yücesan F.B., Sefer Ö., Yörük E.
I. International Agriculture, Animal Husbandry and Forestry Sciences Congress
-
2025
Antifungal activity of volatile organic compounds in Trichoderma brevicompactum
Yıldırım R., Atakan A., Maraklı S., Sefer Ö.
4th International Korkut Ata Scientific Research Congress
-
2025
Kavi S. S., Özer S., Yörük E.
10. Bilim Günleri Kongresi İstanbul, Türkiye
-
2025
Biyokontrol Ajanlarının Etkisi Altındaki Fusarium spp.’de Transkriptomik İncelemeler
Orhan B., Birgün T., Yörük E.
8th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2025)
-
2024
Yörük E.
7th EuroAsian Biodiversity Symposium Erzurum, Türkiye
-
2024
In silico analyses of plant miRNAs targeting Fusarium graminearum
Sefer Ö., Maraklı S.
XV International Scientific Agriculture Symposium AGROSYM 2024
-
2024
Optimization of CBDP marker to determine allelic variation in rice cultivars (Oryza sativa L.)
İbişoğlu M.S., Sefer Ö., Yörük E., Yılmaz S.
XV International Scientific Agriculture Symposium (Agrosym 2024) Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
-
2024
Mitogenome targeted phylogenetic analysis in Fusarium head blight pathogens
Yörük E.
3rd Bilsel International Efes Scientific Researches and Innovation Congress İzmir, Türkiye
-
2023
Yörük E.
2nd International Molecular Plant Protection Congress Bursa, Türkiye
-
2023
Rutin hidrat’ın Fusarium graminearum patojeni üzerindeki etkilerinin farklı seviyelerde gösterimi
Yörük E.
25. Ulusal Biyoloji Kongresi İzmir, Türkiye
-
2023
Mini-prep protocol for simplified RNase A extraction
Yörük E.
6th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences Ankara, Türkiye
-
2023
Investigation of thiram-induced cellular responses in Fusarium reference strains
Yörük E.
2nd International Molecular Plant Protection Congress Bursa, Türkiye
-
2023
Barak T. H., Özsoy E., Servi H., Yörük E.
25. Ulusal Biyoloji Kongresi İzmir, Türkiye
-
2023
Chloroplast genome targeted phylogenetic analysis in Cucurbitaceae family
Yıldırım M., Yörük E.
6th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2023) Ankara, Türkiye
-
2022
Determination of resistance levels of Hordeum vulgare L. lines grown in Türkiye against F. culmorum
Ünal S., Özsoy E., Sefer Ö., Tufan Dülger A.F., Öztürk Gökçe Z.N., Yörük E.
6th International Anatolian Agriculture, Food, Environment and Biology Congress Kütahya, Türkiye, 9 Ekim 2022
-
2020
Genome-wide and gene-specific epigenetic analyses in Fusarium species
Sefer Ö., İbişoğlu M.S., Yörük E., Yılmaz S.
IV. International Eurasian Agriculture and Natural Sciences Congress
-
2019
A Study on Expression Levels of Some Genes in Mar Regulon in the Presence of Urine
Gümüş D., Kalaycı Yüksek F., Sefer Ö., Yörük E., Uz G., Anğ-Küçüker M.
8th Congress of European Microbiologists (FEMS 2019) Glasgow, United Kingdom
-
2019
The Effects of Human Urine on Growth and Gene Expressions in UPEC
Kalaycı Yüksek F., Gümüş D., Sefer Ö., Yörük E., Uz G., Anğ-Küçüker M.
8th Congress of European Microbiologists (FEMS 2019)
-
2018
Yörük E.
3rd International Congress on Food Technology Nevşehir, Türkiye
-
2018
Sefer Ö., Yörük E., Tunalı B., Kansu B., Sharifnabi B., Yil-Mattila T.
IX International Scientific Agriculture Symposium (AGROSYM 2018) Jahorina, Bosnia and Herzegovina
-
2018
Yörük E., Sefer Ö., Tunalı B., Meyva G., Demiray K.
IX International Scientific Agriculture Symposium (AGROSYM 2018) Jahorina, Bosnia and Herzegovina